Основа деятельности отдела – диагностические исследования с помощью ультразвукового, рентгенологического и магнитно-резонансного оборудования.
Отдел лучевой диагностики состоит из 3-х подразделений: рентген–кабинетов, КТ и МРТ – кабинетов и кабинетов ультразвуковой диагностики.
Отдел лучевой диагностики исторически возник на основе рентгенологического отделения, которое как научное подразделение института было организовано в 1946 г. по инициативе А.Н.Сызганова.
С 1986 года функционирует подразделение ультразвуковой диагностики (УЗД). С 1993г. под руководством профессора И.Х. Мухамеджанова в лаборатории ультразвуковой диагностики стали внедряться новые методики исследования с приобретением новейших диагностических аппаратов. В настоящее время проводятся исследования органов брюшной полости и забрюшинного пространства, органов малого таза, молочной и щитовидной желез, поверхностных мягких тканей, плевральных полостей, органов средостения, мошонки, лимфатических узлов, допплерография сосудов брюшной полости, почечного трансплантата, сосудов шеи, верхних и нижних конечностей, ультразвуковое исследование сердца с использованием цветового допплеровского картирования (эхокардиография, допплерэхокардиография).